21.06.2016

ДНК позволит выследить редкую пещерную амфибию

На прошедшей недавно 23-й Международной конференции по биологии пещер, проходившей в Арканзасском университете, был представлен метод, разработанный группой ученых, который предназначен для обнаружения фрагментов ДНК в пробах подземных вод. Он позволит выяснить, где обитают пещерные животные, редко попадающиеся на глаза исследователям. Идею метода его создатели позаимствовали из криминалистики.

Молекулярный биолог Шпела Горицки (Spela Goricki) из лаборатории в пещере Тулар в Словении решила взять на вооружение метод криминалистики. Для расследования преступлений уже довольно давно используется техника, которая обнаруживает ДНК из фрагментов кожи, волос и других клеток организма, попавших в окружающую среду. Также этот метод применяется для отслеживания в реках инвазивных видов рыб. Шпела Горицки и ее коллеги решили определить по ДНК в водах пещерных рек, в каких из них обитает европейский протей (Proteus anguinus) – редкое животное класса амфибий.

За 300 лет, в течение которых ученым известно о существовании этого вида, его наблюдали не более трехсот раз. Он обитает в карстовых пещерных водоемах Словении, Хорватии, Боснии и Герцеговины и Черногории. В 1986 году словенские ученые описали особый подвид протея (Proteus anguinus parkelj), имеющий черную окраску. Он был замечен всего в четырех пещерных водоемах на юго-востоке Словении.

На основе собранных ранее образцов Шпела Горицки разработала генетические зонды – короткие отрезки генетического материала, которые позволяют отличить ДНК протея от генетического материала других организмов. Более того, она научилась даже различать по ДНК обычного белого и черного протеев. Исследовательница и ее коллеги обследовали подземные водоемы в десятках пещер Словении, Боснии и Герцеговины и Черногории, в которых теоретически мог бы обитать протей.

Как оказалось, и белые, и черные протеи обитают в целом ряде мест, где их никто никогда не видел. Их ДНК была выявлена в пробах воды. Например, число пещер, где обитает черный протей, увеличилось до девяти. Более того, ученые обнаружили, что два подвида иногда живут в одних и тех же подземных речках, но не скрещиваются между собой, а значит, вероятно, их можно признать двумя отдельными видами. Шпела Горицки полагает, что данный метод пригодится для выслеживания других редких и исчезающих видов. Биологи отмечают, что могут теперь не только определять наличие вида по его ДНК в воде, но и по концентрации ДНК судить о примерном количестве особей.

Источники:

1. polit.ru